王凤将杜钦的谏言报告给王太后，太后却认为上古时的事情，不用当真。杜钦不放弃，又苦口婆心地劝谏：“‘殷鉴不远，在夏后之世’，前人的失败教训，值得后人警醒。皇后、嫔妃制度是皇帝能否享寿、国家是否遭受祸乱的关键。传说周康王某日未按时早朝，人们纷纷猜测是因他身边无德之女的缘故。一位贤良的妃子，应在每日黎明时分以清脆悦耳的珠翠之声唤醒君王，避免他沉溺于春宵之中。《关雎》这首诗叙述了周康王夫人为君王挑选后妃的故事，颂扬“后妃之德”的重要。人们都希望皇帝有德，享寿天年，国家太平祥和。《诗经》歌颂淑女是君子的好配偶，强调忠孝的意义、仁德的重要。皇帝迎娶九女的制度，合乎上古的遗训，应该从天子即位开始，就保证后宫制度清明，为汉家天下夯实基础，此事不能疏忽，不能再质疑。”
但王凤不能制定制度，只能按照老规矩办事。恰好王太后的妹妹司马君力与杜钦哥哥的儿子通奸，被举报到王太后那里，杜钦深感惭愧、惶恐，便请求辞去官职，退休在家。
再后来发生日食、地震，朝廷在全国举荐贤良方正、敢于直言的士人，合阳侯梁放推荐了杜钦。杜钦上奏说：“我听说发生日时、地震是由于阴盛阳衰。臣子是君的阴面；儿子是父亲的阴面；妻子是丈夫的阴面；夷狄是中原的阴面。《春秋》记载，在240年间，日食发生36次，地震发生五次。每次发生，或夷狄侵犯中原，或朝政被臣下掌握，或妇人欺凌丈夫，或臣子背叛君主，事情虽然不同，但道理相通。如今我观察当朝，并没有这些情况，剩下的就只有后宫。夜晚在未央宫，可以感觉到地震，这一定是皇后嫔妃间争宠，以至于相互诋毁伤害。一切变故都有天人感应，人世间的事情有缺失，灾异就会发生，以德应对，灾异就会消退。殷商的武丁看到野雉飞到鼎耳上，向自己发出警示，便自我检讨，修正错误，因此享寿百年，殷商因此中兴，关键应对的方法非诚不立，非信不行。春秋时的宋景公不愿意将灾祸嫁祸于人，再三表示人君的诚意，荧惑星因此隐退。愿陛下摆正皇后、嫔妃间的关系，抑制后宫女宠，戒除奢靡，减少游戏，躬行节俭，亲自处理朝政，这样即使有灾异，也会消除。切不可淫逸度日，奢靡无度。愿陛下抛弃没有益处的享受，为天下百姓着想。”杜钦的谏言切中时弊，直言不讳，可惜没有收到效果。
当年夏天，成帝召集敢于直言的士人到白虎殿，围绕治国之道展开策问，要求士人依据经学提出对策。杜钦在对策中系统阐述了效法天地、施行仁政等主张，提出“抑文尚质”“废奢长俭”等施政方针，并援引《六经》及孔子言论强化观点。他的对策以“天道贵信”“孝为德行之首”为核心，强调选贤任能，同时直谏君主偏宠后宫、奢侈无度等问题，主张通过“正后妾、抑女宠”改革时弊。
杜钦因生病免去官职，后来担任议郎，又因有病，再次辞职，便在大将军王凤幕府担任幕僚，但凡有国家大政王凤都要和杜钦商议。杜钦不仅善谋，而且善于识人，当时的名士王骏、韦安世、王延世等得到过他的推荐，冯野王、王尊、胡常等，因为过失得到过杜钦的解救。汉初的功臣，有很多人的后代已经失去爵位，杜钦建议应该续封他们的后人。成帝朝好的政治措施如安抚四夷等多出自于杜钦的建议。
杜钦看到王凤的权位太重，就劝道：“周公有至圣之德，还是成王的叔父，管叔、蔡叔的流言仍然让他恐惧；秦国的穰侯魏冉是昭王的舅舅，在昭王年幼时就辅佐朝政，但是一介异国人范睢，仅一次游说，穰侯就被贬回封国；再看近代，武安侯田蚡被武帝斥退。希望将军有周公的谨慎，避免穰侯的强势，戒除武安侯的奢靡，不要让范睢似的小人有可乘之机。”
果然不久，天上发生日食，京兆尹王章趁机弹劾王凤。王凤恐惧，杜钦建议王凤上书谢罪，请求退休。奏书写的很感人，太后看了，哭着不肯吃饭。成帝在年幼时就与舅舅王凤的关系很好，也不忍心斥退王凤，便让王凤留任。王凤却深感惭愧，坚称病重，还是请求退休。杜钦又劝他说：“王章只是一个毫无根基的官员，对于朝臣的进退，只有建议之权，掌握去就还是要由皇上决定。古时周公年老，仍然住在京师，以表明不会离开成周，不会忘却王室，更何况将军与皇上。要使天下太平无事，只有将军辅佐皇上。愿将军不要因为谣言，让皇上为难，应始终对皇上报以忠心。”王凤这才又重新处理政事。成帝让尚书弹劾王章，王章死在昭狱。
百姓都认为，王章死的冤枉，便讥讽朝廷。杜钦又劝王凤说：“王章犯罪的事情很隐蔽，百姓会以为王章是因为向朝廷谏言获罪，如果这样就堵塞了谏言之路，有损朝廷虚心纳谏的诚意。应该让朝臣直言进谏，在郎官面前详细解释王章为何获罪。还有此前日食之事也要昭告四方，让天下人知道，主上圣明，不会因为谏言而获罪。这样流言自然会消除，疑惑也会解开。”杜钦和王凤相辅相成，王凤是杜钦的伯乐，杜钦也纠正和弥补了王凤的很多过错。
杜钦充当幕僚，不担任官职，可以享受天年，寿终正寝。杜钦的儿子及昆弟、亲属做到二千石官员的有十人。杜钦在史书中留下的事迹很少，但他对王凤执政期间的朝政影响很大。残疾的身体使他不能在朝堂上挥斥方遒。但他多谋善断，在成帝建始初年以《女戒》提出谏言，结果也证明了他的远见卓识。他大概就是人们所说的“大隐隐于朝”的高士吧。