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联盟在星云战役取得胜利后，迅速展开了战后重建与隐患排查工作。艾洛斯星系以及其他在战争中受到波及的星系，满目疮痍，基础设施遭到严重破坏，无数民众流离失所。联盟立刻启动紧急救援机制，调集大量资源和救援队伍前往受灾星系。
工程舰队奔赴各个受损星球，运用先进的修复技术，对破碎的城市、瘫痪的能源设施以及毁坏的交通网络进行修复与重建。建筑机器人在废墟上忙碌穿梭，巨大的能量焊枪闪烁着光芒，将一块块破碎的建筑材料重新拼接。同时，医疗团队争分夺秒地救治伤员，搭建临时医疗站，为受伤的民众提供及时的治疗。
在重建工作紧张进行的同时，联盟情报部门与科研团队联合展开了对黑暗势力残余隐患的全面排查。他们深入研究在神秘建筑和黑暗势力战舰上获取的各种技术资料和数据，试图从中找出黑暗势力可能隐藏的后手。
科研人员发现，黑暗势力在能量增幅装置的研究中，运用了一种极其危险的亚空间能量技术。虽然装置已被摧毁，但这种技术如果落入心怀不轨者手中，仍可能引发巨大灾难。情报部门根据这一线索，对整个宇宙空间展开了地毯式搜索，追踪任何与该技术相关的蛛丝马迹。
在排查过程中，一支侦察小队在一个偏远的小行星带发现了异常信号。信号源来自一艘废弃的黑暗势力科研飞船，飞船周围布满了神秘的能量干扰场，阻碍了侦察小队的接近。
“这很可能与黑暗势力的残余计划有关。”侦察小队队长谨慎地分析道。他们尝试与飞船建立通讯，但没有得到任何回应。在请示联盟总部后，侦察小队决定小心靠近，探索飞船内部的秘密。当他们缓缓靠近那艘散发着诡异气息的飞船时，谁也不知道里面隐藏着怎样的危险和秘密，而这一发现又是否会引发联盟与黑暗势力的新一轮冲突，一切都充满了未知……