联盟在经历此次挫折后，痛定思痛，迅速展开全面升级与战略调整。
首先是情报网的升级工作。各星系的顶尖科技人才汇聚一堂，夜以继日地研究应对黑暗势力干扰技术的方法。他们发现，通过在监测设备上增加一种基于量子纠缠原理的探测模块，可以有效识别黑暗势力舰队伪装所利用的能量波动。经过紧张的研发与测试，新型探测模块被迅速安装到遍布宇宙的情报监测设备上，大大增强了情报网的探测能力。
与此同时，联合科研小组在武器和防御系统的研发上也取得了重要突破。他们成功研制出一种名为“相位扰乱器”的武器，这种武器能够发射特殊的能量波，干扰黑暗势力战舰护盾和武器系统所依赖的相位场，使其暂时失效。为了配合“相位扰乱器”的使用，科研人员还对联盟战舰的能量输出系统进行了优化，确保武器能够稳定、高效地运行。
在防御方面，联盟科学家借鉴了不同星系的护盾技术，研发出一种新型复合护盾。这种护盾结合了能量护盾和实体护盾的优点，不仅能够抵御强大的能量攻击，还能对物理攻击进行有效缓冲。新型护盾被逐步安装到联合舰队的战舰上，显著提升了舰队的整体防御能力。
在战略层面，联盟对舰队的部署和作战计划进行了重大调整。原本分散在各星系的防御力量被重新整合，形成了几个关键的战略集群。这些集群分布在重要的星系节点和交通要道，既能相互支援，又能对黑暗势力的进攻做出快速反应。
同时，联盟制定了主动出击的战略方针。他们不再满足于被动防御，而是计划通过对黑暗势力据点的侦察和分析，寻找合适的时机发动突袭，打乱敌人的部署，削弱其有生力量。为了实现这一目标，联盟组建了一支由各星系精英组成的特种作战部队，专门负责执行深入敌后的侦察和破坏任务。
尼奥在联盟高层会议上强调：“我们不能再等待黑暗势力来攻击我们，必须主动出击，掌握战争的主动权。但这一切都需要我们各星系紧密合作，共同为了宇宙的和平与安宁而努力。”各星系代表纷纷表示赞同，联盟在经历挫折后，以更加坚定的决心和全新的姿态，准备迎接与黑暗势力的最终对决……