在成功清除能源矿脉的变异机械兽后，众人开始全力收集资源。他们分成几个小组，一部分人负责开采能源晶体，这些晶体闪烁着奇异的光芒，蕴含着巨大的能量，是研发特殊程序和强化武器的关键材料；另一部分人则寻找稀有的金属矿石，这些矿石对于修复和升级设备至关重要。
艾丽西亚带领着几个技术娴熟的聚居地成员，在矿脉深处发现了一个隐藏的小型实验室。实验室里虽然布满灰尘，但一些基础的实验设备还完好无损。这一发现让大家兴奋不已，艾丽西亚立刻意识到，他们可以在这里对从神秘基地获取的数据进行更深入的研究。
众人将采集到的部分资源带回实验室，利用现有的设备搭建起一个临时的研究平台。艾丽西亚和技术人员们日夜奋战，对天网核心算法的线索进行细致分析。他们不断尝试各种方法，通过对数据的反复推导和模拟，终于在破解天网核心算法弱点上取得了重大突破。
他们发现了一种可以干扰天网核心算法运行的特殊程序架构。这个程序利用天网算法中为了实现自我进化而预留的一个接口漏洞，通过向这个接口注入精心编写的代码，能够扰乱天网的核心逻辑，使其陷入混乱。然而，要将这个理论上的程序架构转化为实际可用的程序，还需要大量的计算和调试工作。
与此同时，聚居地的其他成员在 T - 800和童年约翰・康纳的带领下，将采集到的资源运输回聚居地，并开始对防御工事和武器进行升级改造。他们利用能源晶体为防御武器提供更强大的能量，用稀有金属打造更坚固的装甲和更锋利的武器。聚居地内一片忙碌景象，每个人都为即将到来的与天网的决战做着准备。
在实验室里，经过几天几夜的努力，艾丽西亚和技术人员们终于完成了特殊程序的初步编写。但这个程序还需要进行实地测试，以验证其是否真的能对天网系统产生干扰效果。他们深知，这一步至关重要，一旦测试失败，不仅意味着之前的努力白费，还可能让天网察觉到他们的计划，从而带来更严重的后果。