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就在人类联盟陷入极度困境之时，转机悄然出现。一支此前外出探索的人类联盟探险队在归途中发现了泽尔塔文明的一处重要能源补给站。这个补给站储存着大量泽尔塔部队所需的高能晶体，是泽尔塔维持战争机器运转的关键所在。
探险队队长当机立断，决定对泽尔塔能源补给站发动突袭。他们利用对周边地形的熟悉，悄悄接近补给站，然后发动了突然袭击。补给站内的泽尔塔守军毫无防备，被探险队打得措手不及。
探险队迅速破坏了补给站内的能量储存装置和运输设备，大量高能晶体发生爆炸，引发了连锁反应。整个补给站陷入一片火海，泽尔塔文明的能源补给线遭到了严重破坏。
泽尔塔部队得知能源补给站遇袭的消息后，阵脚大乱。正在进攻人类联盟边境的部队不得不分出一部分力量回援，这使得人类联盟边境防线的压力顿时减轻。
成年约翰・康纳抓住这个机会，指挥部队发动反击。人类联盟的战士们士气大振，他们从防御转为进攻，对泽尔塔部队展开了猛烈的攻击。在人类联盟的反击下，泽尔塔部队开始节节败退。
与此同时，在能源供应基地内，按照新参数发射的反向能量脉冲终于成功中和了量子病毒。基地内的设备逐渐恢复正常，能源供应也稳定下来。
“病毒已被消灭，基地恢复正常！”艾丽西亚兴奋地向童年约翰・康纳报告。
童年约翰・康纳得知这两个好消息后，心中大喜。“乘胜追击，彻底击退泽尔塔部队！”他通过通讯设备向所有部队下达命令。
人类联盟的部队在边境和能源供应基地同时展开全面反击。边境上，战士们勇猛无比，将泽尔塔部队打得溃不成军；能源供应基地这边，童年约翰・康纳带领部队清除了周边剩余的泽尔塔攻击力量。泽尔塔文明此次精心策划的进攻在人类联盟的顽强抵抗下，逐渐走向失败。但泽尔塔文明肯定不会就此罢休，人类联盟又该如何应对他们接下来可能发起的报复行动呢？