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就在泽尔塔渗透特工准备释放量子病毒之时，人类联盟能源供应基地的一名技术人员在进行日常设备巡检时，发现了一些异常的能量波动。这些波动与基地内正常的能量运转模式截然不同，引起了他的高度警惕。
技术人员立刻将这一情况上报给基地指挥官。基地指挥官不敢大意，迅速组织安保人员对基地进行全面排查。同时，消息也传到了人类联盟总部，童年约翰・康纳和成年约翰・康纳得知后，意识到可能有泽尔塔的渗透部队潜入了基地。
“立刻封锁能源供应基地，绝不能让他们得逞！”童年约翰・康纳通过通讯设备下达命令。
基地内，安保人员在各个角落展开搜索。泽尔塔的渗透特工察觉到了危险，他们加快了释放病毒的准备工作，试图在被发现之前完成任务。
在基地的一个隐蔽角落，一名泽尔塔特工正准备启动量子病毒发射装置，突然，一道强光照射过来，“不许动！”人类联盟的安保人员举着武器，将他团团围住。
然而，就在这时，其他泽尔塔特工也被发现，双方随即展开了激烈的交火。泽尔塔特工凭借先进的武器和隐形装置，与安保人员展开周旋。但人类联盟的安保人员人数众多，且熟悉基地地形，逐渐占据了上风。
在激烈的战斗中，一名泽尔塔特工趁乱启动了量子病毒发射装置。装置发出一阵微弱的光芒，量子病毒开始以极快的速度在基地内的能量网络中传播。
“不好，病毒已经开始扩散了！”一名技术人员惊恐地喊道。童年约翰・康纳得知这一消息后，心急如焚，他立刻带领一支精锐的应急部队，朝着能源供应基地疾驰而去。他必须在病毒扩散到整个联盟之前，找到阻止病毒传播的方法，否则人类联盟将面临前所未有的危机。那么，童年约翰・康纳能否及时阻止量子病毒的蔓延，拯救人类联盟于水火之中呢？
第十二卷病毒